Soneja es una población de la comarca del Alto Palancia, que en la actualidad cuenta con una población cercana a los 1500 habitantes de derecho, situada en el valle medio del Palancia, al sureste de Segorbe, sobre la margen derecha del río. Su término municipal actual tiene una extensión de 29 km2, con una forma irregular y alargada. Limita al norte con Azuébar, Almedíjar y Chóvar, al sur con Sot de Ferrer, Algar de Palancia y Sagunto (estos en la provincia de Valencia), al este con Alfondeguilla, al oeste con Castellnovo, y al suroeste con Segorbe. Del término hay que destacar, a efectos geográficos, la contraposición de paisajes entre la zona del valle, en la que se asienta el núcleo de población, y las zonas que se aproximan a la sierra de Espadán. De todas formas, en el término no se alcanzan alturas considerables. Las mayores son en la partida de Palomera, con alturas de 608 metros sobre el nivel del mar. En la zona del núcleo de población y la huerta, las alturas oscilan sobre los 263 metros sobre el nivel del mar.

Junto a la población desembocan las ramblas de Rovira y Almedíjar. Más hacia el este el término está atravesado por la rambla de Azuébar, cerca de la cual se encuentran las fuentes de Bolós y Jáyar. Junto a la partida de Jáyar se halla la partida de Almarós, una llanura de secano que, en la actualidad está ocupada principalmente por cultivos de olivo y almendro, pero que en épocas anteriores se dedicaba al cultivo de trigo y vid. El término se cierra en su parte más occidental por las partidas de La Dehesa y Escalas. La Dehesa constituye un enclave natural de gran importancia, se trata de una montaña con una altura de 450 metros sobre el nivel del mar, en cuya cima existe una pequeña laguna, alrededor de la cual hay gran variedad de fauna y flora mediterránea, de gran valor ecológico.

El clima es templado, típicamente mediterráneo, con inviernos suaves y veranos calurosos. Las temperaturas máximas anuales pueden llegar hasta los 36 º en verano, mientras que en invierno, en ocasiones se alcanzan temperaturas cercanas a los 0º. La pluviosidad se sitúa en torno a los 450 mm anuales, alcanzando mayores cotas entre los meses de abril/mayo y agosto/octubre. Los periodos de escasez de lluvias se encuentran entre junio/julio y noviembre/enero.